1997年就读于中央民族大学声乐系，师从声乐系主任糜若如教授。
1998年考入中国歌舞团任独唱演员。
1999年因演唱《水上花》一举成名，获得全国电台《中国原创歌曲总评榜》最佳新人奖及十大金曲奖。同年获得中央电视台第五届音乐电视大赛三项金奖（演唱金奖、最佳新人奖、后期制作金奖），至今无人超越。同年推出首张个人专辑《水上花》。
2001年被海外媒体誉为中国内地“最具潜力歌手”。
2002年，推出第二张个人大碟《想入非非》破自己的音乐极限，相继推出了《爱人》、《大红绸子飘起来》、《飘》、《龙抬头》《世界》《中国河》等歌曲。并参加央视春节联欢晚会及各类大型晚会，如《同一首歌》、《中华情》、《欢乐中国行》等。
2008年，王菲菲联手著名旅美作曲家胡晓鸥，内地著名音乐人谭伊哲，推出全新风格的舞曲EP《大篷车》，带来全新的电子舞曲梦幻之旅。
2009年，王菲菲破茧而出，带来个人第三张大碟——国内首张ChineseTrip-Hop大碟《TryToFly》,成国内ChineseTrip-Hop第一人，并推出首次“TryToFly视听盛宴”演唱会，得到来自社会各界的广泛赞誉。同年“飞音乐”《TryToFly》获第七届中国金唱片奖。
2010年10月29日，王菲菲爱护动物“HELP！行动”正式启动，全新公益“HELP！”EP唱片上市。
2011年4月16日在北京世纪剧场举办首场个人演唱会，以此启动“【输入-输出】‘飞音乐’巡回演唱会”；2011年6月受邀演唱《远飞的大雁》参加庆党90周年“红歌嘹亮――北京音乐广播纪念中国共产党成立90周年演唱会“；7月13携伊春城市代言歌曲《伊春恋歌》唱响第一届【中国森林音乐会】；受邀担任《星光大道》评委。2011年11月，王菲菲受《欢乐中国行》节目组邀约，参与“欢乐中国行·魅力信阳”节目录制，演唱歌曲《大红绸子飘起来》。
2012年2月发行EP《渐变》；6月发布单曲《爸爸的肩头》。2012年8月27受邀央视大型《七夕晚会》，演唱歌曲《爱人》；9月受邀央视《中秋晚会》，现场全新演绎成名力作《水上花》；9月26号受邀任央视海外频道《无国界好声音》歌唱比赛评委。10月11王菲菲受邀《武当大兴六百年》大型文艺晚会，演唱《逍遥江湖鸳鸯剑》，此曲将晚会现场气氛推向第一个高潮。
2014年至今在北京文艺频道播出的互动励志类综艺节目《我家有明星》中受邀担当“梦想助力团”点评导师；2014年至今担任《我家有明星——天才宝贝追梦春晚》评委。
2015年3月发行原生态EP《云南记忆》。
2016年1月受邀为“华语音乐排行榜《寻找（城市）最美声音》评委；2016年1月受邀为央视微电影频道《美丽中国》系列演唱《巫山恋歌》；2016年1月至3月，王菲菲和李伟健、王洁实、包胡尔查、宋宁、秦天等共同出演北京电视台文艺频道季播喜剧小品综艺节目《哎呀妈呀》第一季，共计12期。6月发布新歌《北京这座城》、《心中的布达拉》、《绣缘》。
王菲菲应邀参加多届中央电视台《春节联欢晚会》、北京卫视《春节联欢晚会》，和多次受邀参加央视《七天乐》、《爱电影》、《民歌中国》、《中华情》、《欢乐中国行》、《欢乐一家亲》、《巅峰音乐会》、《天天把歌唱》等大型节目录制。
2019年7月，发行单曲《吃饭要吃蒜》。
