1995年,在北京电影学院表演系研究所就读研究生并担任助教的黄磊遇见参加北京电影学院新生入学考试的孙莉,对孙莉一见钟情,两个月后(1995年10月24日),黄磊向孙莉表白,孙莉点头答应,两人便顺理成章的成为了男女朋友,那年黄磊24岁,孙莉18岁。2001年两人就说要结婚了,结果人家说新世纪第一年不适合结婚,虽然不信,但是既然有人讲自然要避讳,到了2002年,两人要结婚,又有人说了,那年是‘盲春寡妇年’。这一拖就到了2003年,非典来了。2004年3月8日,孙莉和黄磊步入婚姻殿堂。
2006年两人育有一女黄忆慈,小名多多,2013年8月孙莉再次怀孕。2017年5月27日,孙莉与黄磊的第三个孩子出生。